Ta zakon začne veljati petnajsti dan po objavi v Uradnem listu Republike Slovenije, razen prve alinee 8. člena tega zakona, ki se, razen za obračun uporabnine, začne uporabljati 1.1.2005.
Zakon o spremembah in dopolnitvah Zakona o železniškem prometu - ZZelP-D (Uradni list RS, št. 56/03) vsebuje naslednjo prehodno in končno določbo: