Leta 1990 je bil med delegati na zadnjem kongresu Zveze komunistov Jugoslavije, ki ga je slovenska delegacija predčasno zapustila. Bil je med tistimi, ki so zahtevali čimprejšnji odhod, tudi zato, ker naj bi jih vsaka dodatna minuta v Beogradu stala glasov na bližajočih se prvih večstrankarskih volitvah v Sloveniji. Na volitvah je takrat zmagal Demos, Pahor pa je bil na listi Stranke demokratične prenove (SDP), torej na listi prenovljenih komunistov, izvoljen za poslanca družbenopolitičnega zbora republiške skupščine, takratnega parlamenta.