Svet je sicer posvetovalni organ vlade, ki med drugim fakultetam podeljuje dovoljenja za ustanavljanje, predavateljem pa habilitacije. Ko je pred dvema letoma, malo po nastopu Janševe vlade, predsednik sveta postal Peter Jambrek, sicer pomemben član SDS, je to povzročilo veliko ogorčenja. Mnogi so menili, da na čelu inštitucije, ki bi morala bdeti nad visokim šolstvom v celoti, pač ne bi smel sedeti lastnik zasebnega podjetja ‐ Jambrek pa je bil takrat lastnik in dekan zasebne fakultete FPDEŠ.