Ravno v tistem času je nastopila svoj mandat Bajukova vlada. Obrambni minister je postal Janez Janša, notranji pa Peter Jambrek, ki je na mesto generalnega direktorja policije postavil Marka Pogorevca. Vse do septembra 2003, ko je Mladina objavila, kakšna so bila odkritja Sovinih agentov in kako nenavadno je potekala preiskava velike kraje, se o postojnskem orožju, kljub temu da se je z njim ukvarjala celo komisija za nadzor varnostnih in obveščevalnih služb, ni veliko govorilo.