64-bitna različica Viste vsebuje tudi tehnologijo za zaščito pred korenskimi kompleti ali »rootkiti«. Korenski kompleti so programi, ki se ugnezdijo v sistem in svojo navzočnost zakrijejo pred protivirusnimi in drugimi varnostnimi programi ‐ spreminjajo jedro operacijskega sistema, manipulirajo funkcije jedra. S filtriranjem prikaza svojih procesov in datotek se poskušajo skriti pred protivirusnimi programi. 32-bitna različica Windows Viste te zaščite nima.