Ob prvi povezavi tudi določimo vrsto zapisa na iPodovem disku, ki je lahko združljiva z Maci (HFS+) ali PCji (FAT32). Žal ni priložen program (recimo XPlay), ki bi omogočal hkratno združljivost iPoda za obe vrsti računalnikov, lahko pa ga kupimo v spletu.
V iPodu lahko shranjujemo glasbo v zapisu mp3 (do 320 kB/s), aac, aiff in wav, podprt pa je tudi zapis zvočnih knjig, audible.