Izhodišče za delo agencije je nacionalnovarnostni program, ki ga sprejme državni zbor. Vladi je prepuščeno, da naloge, opredeljene v nacionalnovarnostnem programu, prednostno razvrsti ter določi prioritete, ki jih pri operacionalizaciji mora upoštevati agencija v letnih programih dela.
V amandmiranih predlogih so torej v letnih programih dela opredeljene naloge, ki jih agencija nato v prvem mesecu vsakega tekočega leta predstavi vladi in pa komisiji za nadzor nad delom obveščevalnih služb, torej temu državnemu zboru.