O upravičenosti do odškodnine in njeni višini odloča Uprava v upravnem postopku na podlagi odločbe o odrejenih ukrepih, zapisnika pristojnega inšpektorja o izvedenih ukrepih in na podlagi poročila posebne komisije o ugotovljeni višini odškodnine. Višino odškodnine ugotovi posebna komisija, ki jo imenuje predstojnik Uprave in jo sestavljajo vsaj trije člani z najmanj visoko strokovno izobrazbo s področja kmetijstva, gozdarstva ali ekonomije.
Zoper odločbo o višini odškodnine ni mogoča pritožba in tudi ne upravni spor.