Za pošiljke iz prvega odstavka 25. člena tega zakona minister predpiše višino pristojbine glede na vrsto in količino rastlin, rastlinskih proizvodov in nadzorovanih predmetov v skladu s predpisom, sprejetim po postopku iz drugega odstavka 18. člena direktive.
Obveznost plačila pristojbine nastane z dnem izdaje fitosanitarnega spričevala, potrdila o zdravstveni ustreznosti, oziroma oprave fitosanitarnega pregleda.
Obveznost iz prejšnjega odstavka mora vlagatelj plačati v 30 dneh od nastanka obveznosti.