Ta zakon začne veljati petnajsti dan po objavi v Uradnem listu Republike Slovenije, uporablja pa se od 1. maja 2004, razen 54. člena tega zakona, ki se uporablja od uveljavitve.
Zakon o spremembah in dopolnitvah Zakona o trošarinah - ZTro-E (Uradni list RS, št. 42/04) vsebuje naslednjo končno določbo: