Finančno gledano sta uspešna tako inštitut kot zasebno podjetje. Po zadnjih dosegljivih podatkih je Inštitut za javno upravo v letu 2003 ustvaril 998.245 evrov čistih prihodov od prodaje (leto prej 730.620 evrov), medtem ko je IJU consulting, d. o. o., v letu 2005 ustvaril 473.199 evrov čistih prihodkov od prodaje, v letu 2006 pa 566.779 evrov.
V zameno za to, da inštitut lahko nosi ime univerze, mora univerzi vsako leto nameniti določen odstotek svojega zaslužka.