Glede na to, da se NZN financirajo iz javnih sredstev, so lahko vedno predmet revizije računskega sodišča.
Računsko sodišče že leta opozarja, da je treba obseg nabav, ki so po naravi stvari izvzete iz sistema javnega naročanja, zmanjšati na najmanjši možen obseg. V tem segmentu so seveda možna določena tveganja za obstoj nepravilnosti oziroma uvrščanja med NZN tudi opremo, ki ne sodi v ta okvir.