Zgodovino hidžer lahko spoznavamo iz več kot štiri tisoč let starih virov, ne le iz pričevanj o nekoč bogati kulturi evnuhov, ki so bili zaposleni na dvorih kot varuhi haremov in svetovalci s pogosto pomembnim vplivom na državne zadeve. Pač zaradi še danes prisotne vere v posebne moči, ki naj bi jih imele hidžre, kar je posledica dimenzije tretjega spola, ki mu pripadajo. Zaradi zunanje podobnosti s hermafroditsko naravo v indijski mitologiji pogosto v eni osebi upodobljenega Šive in njegovega spremstva kot nadčasnega, brezobličnega in brezspolnega bitja so hidžre dobile naziv Šiv-Šakte.