Zakon naj bi zagotavljal pozitivno diferenciacijo glede na vlogo, velikost in vplivnost različnih cerkva in tako po logiki reči preferira predvsem RKC. Kritiki menijo, da preveč širi družbeno dejavnost cerkva in vire financiranje države in dejansko vzpostavlja svojevrstno neenakost možnosti. Zakon verske institucije razume kot prostovoljne nepridobitne organizacije, ki zadovoljujejo javni in ne zgolj zasebni interes ljudi.