Upravljanje železniške infrastrukture bo tako prešlo na Slovenske železnice, medtem ko bo za investicije odslej pristojna nova direkcija v okviru ministrstva za promet, ki bo imela sedež v Mariboru.Nadzorni svet HSŽ se je medtem lotil obravnave ukrepov, ki jih je HSŽ pripravil kot odziv na ugotovitve računskega sodišča v zvezi s poslovanjem v letu 2004. Računsko sodišče je namreč ugotovilo številne nepravilnosti, predvsem o tem, da naloge in pristojnosti niso bile porazdeljene v skladu z zakonom o železniškem prometu.