Ljubljanska, mariborska in koprska univerza tako danes v položaju branijo avtonomijo znanosti in posameznih strok. Politika ne skriva več želje, da bi zlasti ljubljansko univerzo razbila, skregala med sabo dekane, saj pritiska nanje z zmanjševanjem števila študentov in povečevanjem vpisa na zasebne univerze, hkrati pa začenja vzpostavljati vzporedne institucije. Na področju zgodovinopisja je tako v nastajajočem nacionalnem programu visokega šolstva nakazana ustanovitev novega nacionalnega zgodovinskega inštituta.