Z vlado sta pogosto v partnerskem odnosu. Razpustitev Kosove protikorupcijske komisije je denimo predlagala prav Jelinčičeva stranka, vladajoča koalicija pa je predlog velikodušno podprla. Po drugi strani je bil zadovoljen, ko je uspelo novi vladi zakon o javnih uslužbencih spremeniti tako, da si je podelila pravico do predčasnega razreševanja najvišjih javnih uslužbencev, in to zgolj zato, ker so se ji zdeli politično nekompatibilni.