Finančno breme je naložila ministrstvoma za pravosodje ter delo, družino in socialne zadeve, nadzor nad izvedbo pa komisiji za reševanje vprašanj prikritih grobišč. Delež ministrstva za pravosodje gre iz proračunske postavke 'Poprava krivic in narodna sprava', iz katere so financirani vsi raziskovalni projekti Sektorja za popravo krivic in narodno spravo ter strokovna in administrativna podpora komisije za izvajanje zakona o popravi krivic. Delež ministrstva za delo, družino in socialne zadeve pa gre iz postavke 'Vzdrževanje grobov v RS', kjer ima za prekope prikritih grobišč rezerviranih dvajset milijonov tolarjev.