Gotovo zasebne fakultete niso v enakem položaju kot javne, zato se tudi ne bi smele financirati na enak način. Zasebne fakultete ponujajo samo programe, ki so tržno zanimivi, javne pa imajo širšo družbeno vlogo, predvsem pri demokratizaciji družbe, socialni koheziji, vzpostavljanju družbe znanja, skrbi za študijske programe nacionalnega pomena itd. Problem sta tudi zelo ohlapna akreditacija in odsotnost zunanjega nadzora nad kakovostjo zasebnih šol, zato nihče ne more jamčiti, da se sredstva tu porabljajo smiselno in namensko.