Med drugim pomagajo pridobivati kalorije iz sestavnih delov živil, ki so sicer neprebavljivi, denimo iz rastlinskih vlaknin. Vrsta Bacteroides thetaiotaomicron, ki ljubi sladkor in predstavlja okoli šest odstotkov vseh mikrobov v črevesju, proizvaja največji arzenal encimov, ki razgrajujejo ogljikove hidrate ‐ več kot 240 v primerjavi z 98 pri ljudeh. Ti encimi omogočajo razgradnjo vlaknin, v katerih je veliko vrst sladkorja in s tem te sicer nedostopne hranilne snovi posredujejo gostitelju.