Dr. je novembra 2001 kot edini kandidat za predsedniški položaj prevzel vodenje NSI. Nekaj malega se je tedaj šušljalo, da bi se utegnil za predsedniški položaj potegovati tudi , a je ta na kongresu povedal, da si »ne želi klanja, pač pa sodelovanje«. je bil potem izvoljen za predsednika sveta stranke Nekoliko bolj negotovo je bilo, ko se je leta 2000 pripetil združitveni kongres SLS in SKD. Tedaj sta se za prvaka združene stranke potegovala dva kandidata: dr. je zbral 300 glasov, protikandidat pa 195 glasov.