Uvajanje direktive naj bi bilo sporno tudi zato, ker so dokazi, zaradi katerih naj bi posegli v zasebnost posameznikov, prešibki in preveč nejasni, da bi lahko zaradi njih zakonsko uvedli hrambo podatkov. Če pa bo direktiva sprejeta, bo moralo biti v njej jasno zapisano, da gre zgolj za prometne in ne vsebinske podatke in da morajo biti nujno zbrisani po izteku roka, določenega za hranjenje.
Glavni nadzornik EU, ki je pristojen za varovanje podatkov, je v precejšnjih dvomih glede direktive, naši oblastniki pa so povsem nasprotnega mnenja.