Avtonomija se pri nas zelo narobe razlaga. Avtonomija univerze, tradicionalno gledano, ni v tem, da takšna ali drugačna oblast daje univerzi denar, ta pa s tem denarjem naredi, kar hoče. To ni bilo mogoče niti v preteklih stoletjih, kaj šele v 19. stoletju, ko je bila avtonomija univerze na novo definirana.