Nekateri preparati škodijo okolju. Metilni bromid, na primer, je bil nekdaj zelo priljubljen, danes pa je njegova uporaba v številnih državah omejena, saj tanjša ozonsko plast. Drugi pesticidi, denimo nekateri proti termitom, so škodljivi za dragocene predmete, ki naj bi jih zavarovali, saj reagirajo z barvami in laki, tako da se razbarvajo.