Papež II. je dvakrat obiskal tudi Slovenijo. Prvič je bil na državniškem in pastoralnem obisku maja 1996, ko se je ustavil v Ljubljani, Mariboru in Postojni ter s tem zaznamoval 1250-letnico krščanstva med. Drugič pa je k nam prišel 19. septembra 1999, ko je v Mariboru za blaženega razglasil.