Januarja 2000 je tudi njegovo truplo naplavila. Osemindvajsetega novembra 1999 naj bi ga bil utopil s pomočjo in Zvonimirja Vojske (prisotnost mu je svetovala, katere agent je bil). Sodišče meni, da je Vojska stražil, in Kos pa naj bi bila zvlekla do obrežja, kjer naj bi ga bil utopil.
Decembra 1999 je bil izpeljan tudi v vojašnici v Postojni.