Najprej bo posnelo skalo s premerom 0,7 kilometra, nato pa z njene površine na treh mestih pobralo vzorce kamenin, vsega skupaj en gram, in jih shranilo v kapsulo.
Vzorci naj bi na Zemljo prišli junija leta 2007. Hajabusa bo kapsulo spustila s padalom, pristala pa naj bi v Avstraliji. To bodo prvi vzorci asteroida s potrjenim izvorom.