Najprej se je zataknilo že pri obtožnici, ki jo je aprila 2000 vložilo tožilstvo. Ruparjevemu zagovorniku je uspelo proces ustaviti, ker naj župan ne bi bil uradna oseba. Kranjsko okrožno sodišče je temu najprej pritrdilo, vendar se je višje sodišče pozneje strinjalo s tožilcem in je obtožnico potrdilo, da je ta postala pravnomočna.