SDS je za cerkev preveč ateistična, komandant recimo ne podpira uvedbe katoliške pouka o verstvih v javnih šolah. Cerkvenim stališčem je sicer blizu tudi SLS, a s to stranko, njenim združevanjem in razdruževanjem cerkev nima dobrih izkušenj.
Škofi so svoje predvolilno pismo pred štirimi leti končali s pozivom k molitvi za domovino in z besedami »Bog blagoslovi predrago Slovenijo!«.