Zaradi popuščanja energetskemu lobiju je o Naturi 2000 razpravljalo ustavno sodišče.
Na vladno politiko glede okolja je postala pozorna tudi Evropa, Evropska okoljska agencija je konec minulega leta Slovenijo razglasila za edino izmed držav »nove Evrope«, ki do leta 2010 najverjetneje ne bo dosegla ciljev iz kjotskega sporazuma. Ministrstvo se je takrat neprepričljivo izgovarjalo, da je evropska napoved pripravljena na podlagi slovenskih predvidevanj.