Po nekaterih podatkih naj bi bile aleksandrijsko knjižnico sestavljale tri zgradbe: Museion, Serapeion in dodatno skladišče v pristanišču. Slednje ali pa celo skladišče skupaj z Museionom, glede tega si viri niso edini, naj bi bilo žalostno usodo doživelo v požaru leta 47 pr. n. š., ko je v času aleksandrijskih vojn Julij dal zažgati ladjevje Kleopatrinega prvega moža, Ptolemaja XIII. Izgubo je kasneje delno nadomestil Mark, saj je Kleopatri zaradi njene naklonjenosti podaril 200.000 zvitkov iz pergamske knjižnice.