Nevarnost zapleta med Barrosom in francosko-nemškim parom je še večja, ker je prvi podprl vojno v Iraku. V 90. letih je kot zunanji minister poudaril svojo naklonjenost čezatlantskemu zavezništvu, saj naj bi bila Portugalska zaradi zemljepisne lege in zgodovine dolžna negovati tesne vezi z Veliko Britanijo in Združenimi državami Amerike. Bil je gostitelj predvojnega vrhunskega srečanja med ameriškim predsednikom Bushem, britanskim premierom Tonyjem Blairom in španskim premierom Josejem Aznarjem.