Nad akvarijem bi bila velika predavalnica in nekaj spremljajočih prostorov, v pritličju pa tudi trgovina in potapljaška baza z barokomoro.«
Prenova MBP se je pričela, sredstva za akvarij so bila namensko zagotovljena, vendar je, kot odgovarja Urad za investicije MŠZŠ, »pri revidiranju in racionalizaciji projekta, ob združitvi Ministrstva za znanost in tehnologijo in Ministrstva za šolstvo in šport ugotovljeno, da je tak akvarij vsekakor širšega značaja in kot tak ne more biti samo del Morske biološke postaje. Prvotne tri faze investicije so bile spremenjene v dve fazi, ki nista zajemali akvarija«.