Tudi med drugo svetovno vojno so bile alpinske enote vključene v italijansko vojsko, ki je aprila 1941 skupaj s Hitlerjevo armado in njenimi zaveznicami napadla in zasedla Kraljevino Jugoslavijo.
Ena od alpinskih enot, 3. divizija, se je avgusta 1942 kruto znesla nad vasico Ustje pri Ajdovščini, naselje požgala in pobila osem vaščanov. Poleti 1942 pa je italijanska vojska izvedla veliko ofenzivo proti partizanskim enotam na Notranjskem in Dolenjskem.