S tezo Dvoregionalni model splošnega ravnotežja: Slovenija - ostala Jugoslavija leta 1992 doktorira. Julija 1994 se vrne na zavod za planiranje, ki se takrat že imenuje Urad za makroekonomske analize in razvoj, in sicer na položaj direktorja. Izvaja politiko strokovne korektnosti, apolitičnosti in neodvisnosti.