Ko govorimo o zanesljivosti poligrafske metode, se moramo zavedati njenih omejitev. Za to pa je treba najprej dodobra poznati posamezne tehnike in zakonitosti te psihofiziološke preiskave. Poenostavljeni sklepi praviloma povedo več o tistem, ki jih izreče, kot o psihofiziološki preiskavi verodostojnosti izjav s poligrafom.