Težava sistemov za prepoznavo, ki temeljijo na prstnih odtisih, je še vedno velika obremenitev računalniških virov. Za nekatere je tak sistem lahko tudi nesprejemljiv ‐ zaradi najrazličnejših dejavnikov, na primer neustreznih razmer v okolju ali poklicne deformiranosti (fizični delavci, glasbeniki). Najbolj razširjene metode temeljijo na prepoznavanju vzorca ali izvlečku minucij (drobnih značilnosti).