Microsoft seveda ostro nasprotuje ugotovitvam in navaja, da je za uporabo tehnologije MP3 povsem legalno pridobil pravice rabe od enega od patentnih lastnikov, univerze Fraunhofer, za kar naj bi odšteli kar 16 milijonov dolarjev. Proces proti Microsoftu pa ima lahko v prihodnje še zanimive posledice tudi na drugih področjih, saj druge tožbe zajemajo patente s področja grafičnega vmesnika, video tehnologije in nekaterih tehnologij, ki jih je Microsoft uporabil v igralnih konzolah Xbox.