Čeprav so ti programi zelo uporabni, imajo seveda določene omejitve, pogojene s samo tehnologijo. Številni uporabniki ne potrebujejo urejevalnikov za datoteke, saj si jih sami zložijo in shranijo kar v raziskovalcu ali pa uporabljajo okenske nadomestke, kot je npr. Directory Opus. Sodobni brskalniki že v osnovi ali z dodatki podpirajo nadaljevanje prekinjenega prenosa.