A kot sestavni del spletnih strani zna povzročiti tudi nekaj škode. Na srečo v brskalnikih na temelju kode Mozille skriptna koda nima pristopa do operacijskega sistema, vendar še vedno lahko kvari uporabniško izkušnjo ali nam celo ukrade zasebne podatke (t. i. »phising«). Firefox sicer vključuje nekatere omejitve skriptne kode in jo s tem dela varnejšo, vendar si lahko dodatno pomagamo še s pripomočkom NoScript.