After Effects je sicer precej prilagojen tudi drugim Adobovim programom, kot sta Photoshop ali Illustrator, saj zna iz teh datotek uporabiti številne podatke o, denimo, maskah ali ravninah. V After Effects lahko sicer brez večjih težav uvozimo tudi projekte, ki smo jih poprej ustvarili s programom Premiere (ki je za osnovno delo veliko bolj enostaven). Res pa je, da uvoz ni ravno popoln, saj se izgubi velik del učinkov.