Bolj izkušeni razvijalci lahko krmilijo DTS tudi programsko prek izdelanih programskih paketov, ki jih lahko naredijo tako v orodju SQL Server Management Studio kakor tudi v Business Intelligence Development Studio. Opisi vseh predmetov DTS so dokumentirani in objavljeni, tako da je do njih mogoč programski dostop, obstaja pa tudi programski vmesnik (API), s pomočjo katerega je mogoče klicati DTS iz drugih programskih rešitev, v katere je DTS vgrajen kot sestavni del.