Temeljna težava pri programski opremi se skriva v njeni neverjetni zapletenosti. Ker pri njenem razvoju nismo soočeni z običajnimi omejitvami resničnega sveta, lahko že posameznik zgradi in obvladuje sistem, ki ga sestavlja celo na milijone preprostih gradnikov. Vsi ti členi pa so še vedno tesno povezani in med seboj odvisni, kar lahko pripelje do cele vrste čudnih izidov, ki si jih zelo pogosto ne moremo niti zamisliti.