Sveži strežnik pa potrebuje tudi storitve najbolj svežega izvajalnega okolja, JRE 5, ki pa skupaj z javo 5 še ni dokončno dozorelo (glej zgoraj). Novi Tomcat 5.5 je tako zaenkrat namenjen bolj preizkušanju, resnim aplikacijam pa še vedno zvesto služi Tomcat 5, ki je nedavno prav tako doživel osvežitev, ki odpravlja nekatere hrošče (različica 5.0.28).