Pomembna prednost v primerjavi s Konquerorjem iz okolja KDE je, da Nautilus računalnike prikazuje z imeni, Konqueror pa s številko IP.
Še tako zvesti zagovorniki Gnoma so ostali brez besed, ko so jim privrženci drugih okolij očitali predpotopen vmesnik za odpiranje in shranjevanje datotek. A končno je grafična knjižnica osnovnih gradnikov GTK 2.4, ki jo uporablja tudi Gnome 2.6, dobila prenovljen vmesnik za izbiro datotek, ki prekaša tudi marsikaterega sotrpina iz komercialnih okolij.