Registri za ukaze MMX (osem 64-bitnih) in števila s plavajočo vejico (osem 80-bitnih) so enaki tistim pri 32-bitnih procesorjih. Zgoraj opisana zgradba omogoča, da Athloni 64 in Opteroni izvajajo tako današnjo 32-bitno programsko opremo kakor tudi programe, pisane posebej za arhitekturo AMD64, ki se je lahko nadejamo v prihodnosti. Microsoft je že napovedal posebno različico operacijskega sistema Windows XP, medtem ko je Linux že na voljo.