Iz varnostnih razlogov je takrat namreč priporočljivo uporabiti program za pregled diska in zmanjšanje razdrobljenosti zapisa datotek. ScanDisk temeljito pregleda disk, Disk Defragmenter pa podatke na disku razporedi tako, da so v prihodnje lažje in hitreje dostopni. ScanDisk v Windows 98 zaženete tako, da izberete Start|Programi|Pripomočki|Sistemska orodja|ScanDisk/Start|Programs|Accessories|SystemTools|ScanDisk.