Paket programske opreme je pri vseh Microtekovih izdelkih enak, prav tako ni nobenih razlik pri vmesniku TWAIN.
Hitrejši vmesnik in verjetno tudi vgrajena mehanika poskrbita , da se ScanMaker 5900 po hitrosti branja predlog uvrsti v povprečje. Kakovost zajetih predlog je primerljiva s tisto pri modelu 4900, kar priča o tem, da je v oba bralnika verjetno vgrajeno podobno, če že ne povsem enako tipalo.