Varnost povezave je bila pri ustvarjanju standarda bluetooth ključnega pomena, saj je osnovni namen takih povezav prenos precej pomembnih podatkov, kot je, denimo, usklajevanje ročnega računalnika z namiznim ali prenos telefonskega pogovora prek slušalke. V sam standard je vgrajenih več stopenj varnosti, med drugim z izmenjavo ključev, vsako bluetooth napravo pa je mogoče tudi 'narediti nevidno' za vse druge bluetooth naprave, ki bi se skušale z njo povezati. Tudi že vzpostavljena povezava je zaščitena z največ 128-bitno enkripcijo in prej omenjeno hitro menjavo frekvenc.