Mnoge moti, da si je Microsoft pridržal pravico, da nove funkcionalnosti, ki jih bodo razvili partnerji, lahko brez plačila čez čas uporabi v svojih izdelkih. Licenčni program omogoča namreč dvoje - izdelovalec s spremenjeno kodo lahko izboljša delovanje okolja Windows CE, obenem pa dodaja funkcionalnosti, ki jih tekmeci nimajo. Po pogodbenih določilih naj bi ekskluzivnost za spremembe partnerju veljala le pol leta, nato ima Microsoft pravico kodo uporabiti v svojih izdelkih.